食品科学与工程专业隶属食品科学与工程学院，1995年设置，由“农产品贮运与加工专业”演化而来，是全国同类院校中最早设立的食品类专业之一。

1998年申报并经国务院学位委员会批准“农产品加工及贮藏工程”硕士学位授权点，2003年申报并经国务院批准“食品科学”硕士学位授权点；2004年“农产品加工及贮藏工程”学科被确定为山西省重点扶持学科；2006年“农产品加工及贮藏工程”实验室被山西省教育厅确定为重点建设实验室；2006年“食品科学与工程”被评为省级品牌专业；2007年申报并经国务院批准“农业推广”食品加工与安全方向专业学位硕士授权点；2010年申报并经国务院批准“食品科学与工程一级学科硕士授权点”，同年申报并经国务院批准“工程硕士”食品工程方向专业学位硕士授权点。同时学院从2001年开始招收“食品科学与工程”专业双学位学生，2004年招收“食品质量与安全”函授本科学生。2011年被评为山西省高等学校特色专业。