近日，我院朱迎春教授团队在《食品科学技术学报》发表了高水平论文：产脂肪酶木糖葡萄球菌YCC3全基因组测序及序列分析。

木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylosus,S.xylosus)YCC3是从发酵肉制品中分离筛选到的1株产脂肪酶活性高的菌株，为研究该菌株在香肠发酵过程中的代谢机理和功能，采用PromethION和Illumina HiSeq测序平台对S.xylosus YCC3进行图测序分析。结果表明，S.xylosusYCC3基因组为1套含有3个质粒的环状分子，基因组序列总长度为2 773 035 bp，GC含量(鸟嘌呤和胞嘧啶占基因组序列的比率)为32.88%。基因组中预测到2 540个编码基因，编码基因总长度为 2 742 136 bp,平均长度为1 079.58 bp，占基因组的83.24%。S.xylosusYCC3的编码基因通过GO(Gene Ontology)数据库注释，预测到与抗氧化活性相关的基因3个；COG(Cluster of Orthologous Groups of Proteins)数据库注释到与脂质运输和代谢相关的基因中有8个含有脂肪酸合成基因、4个含有脂肪水解酶基因；KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库注释到与脂肪酸合成相关的基因16个，与脂肪酸降解相关的基因10个，与不饱和脂肪酸合成相关的基因3个。S.xylosus菌株的基因组基本功能注释和代谢通路基因信息注释旨在为菌株S.xylosusYCC3作为发酵剂在香肠发酵中的应用提供了理论依据。

由外到内依次为编码基因(正义链),编码基因(负义链),tRNA(橙色)和rRNA(紫色),重复序列、原噬菌体和基因组岛,GC含量,GC偏移(+/-),测序深度。

图1 S.xylosus YCC3的基因组圈图

Fig.1 Circle representation of genome of S.xylosus YCC3

图2S.xylosusYCC3的GO功能分类

Fig.2 GO functional classification of S.xylosus YCC3

图3S.xylosusYCC3的COG注释

Fig.3 COG annotation of S.xylosus YCC3

表1 脂类代谢通路及其相关基因

Tab.1 Lipid metabolism pathways and its related genes

本研究得到山西省应用基础研究计划项目(20210302123400);山西省功能食品产业技术体系建设项目(2023CYJSTX10-03)资金资助。

原文链接：

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